Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
PRDM2Q13029 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PRDM2Q13029 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
PRDM2Q13029 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
PRDM2Q13029 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
PRDM2Q13029 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PRDM2Q13029 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
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