Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASGEF1BQ0VAM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASGEF1BQ0VAM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms