Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCK1Q08629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPOCK1Q08629 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms