Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPOCK1Q08629 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPOCK1Q08629 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPOCK1Q08629 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPOCK1Q08629 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPOCK1Q08629 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPOCK1Q08629 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SPOCK1Q08629 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPOCK1Q08629 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPOCK1Q08629 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPOCK1Q08629 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPOCK1Q08629 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPOCK1Q08629 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPOCK1Q08629 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPOCK1Q08629 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPOCK1Q08629 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPOCK1Q08629 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPOCK1Q08629 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPOCK1Q08629 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPOCK1Q08629 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPOCK1Q08629 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPOCK1Q08629 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPOCK1Q08629 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SPOCK1Q08629 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPOCK1Q08629 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPOCK1Q08629 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPOCK1Q08629 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPOCK1Q08629 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPOCK1Q08629 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPOCK1Q08629 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPOCK1Q08629 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPOCK1Q08629 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPOCK1Q08629 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPOCK1Q08629 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPOCK1Q08629 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPOCK1Q08629 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCK1Q08629 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOCK1Q08629 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPOCK1Q08629 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPOCK1Q08629 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCK1Q08629 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOCK1Q08629 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOCK1Q08629 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPOCK1Q08629 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOCK1Q08629 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOCK1Q08629 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOCK1Q08629 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPOCK1Q08629 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOCK1Q08629 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPOCK1Q08629 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPOCK1Q08629 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPOCK1Q08629 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPOCK1Q08629 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPOCK1Q08629 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPOCK1Q08629 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPOCK1Q08629 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPOCK1Q08629 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPOCK1Q08629 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPOCK1Q08629 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPOCK1Q08629 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPOCK1Q08629 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPOCK1Q08629 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPOCK1Q08629 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPOCK1Q08629 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPOCK1Q08629 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPOCK1Q08629 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPOCK1Q08629 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPOCK1Q08629 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPOCK1Q08629 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPOCK1Q08629 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPOCK1Q08629 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPOCK1Q08629 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPOCK1Q08629 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPOCK1Q08629 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOCK1Q08629 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOCK1Q08629 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPOCK1Q08629 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPOCK1Q08629 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPOCK1Q08629 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPOCK1Q08629 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPOCK1Q08629 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOCK1Q08629 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCK1Q08629 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOCK1Q08629 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOCK1Q08629 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCK1Q08629 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCK1Q08629 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCK1Q08629 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOCK1Q08629 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCK1Q08629 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCK1Q08629 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOCK1Q08629 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms