Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP2P53365 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFIP2P53365 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFIP2P53365 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFIP2P53365 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFIP2P53365 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms