Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCTRP47872 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCTRP47872 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCTRP47872 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCTRP47872 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCTRP47872 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCTRP47872 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCTRP47872 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCTRP47872 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCTRP47872 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCTRP47872 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCTRP47872 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCTRP47872 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCTRP47872 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCTRP47872 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCTRP47872 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCTRP47872 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCTRP47872 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCTRP47872 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCTRP47872 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCTRP47872 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCTRP47872 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCTRP47872 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCTRP47872 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCTRP47872 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCTRP47872 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCTRP47872 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCTRP47872 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCTRP47872 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCTRP47872 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCTRP47872 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCTRP47872 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCTRP47872 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCTRP47872 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCTRP47872 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCTRP47872 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCTRP47872 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCTRP47872 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCTRP47872 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCTRP47872 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCTRP47872 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCTRP47872 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCTRP47872 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCTRP47872 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCTRP47872 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCTRP47872 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCTRP47872 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCTRP47872 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCTRP47872 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCTRP47872 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCTRP47872 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCTRP47872 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCTRP47872 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCTRP47872 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCTRP47872 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCTRP47872 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCTRP47872 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCTRP47872 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCTRP47872 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCTRP47872 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCTRP47872 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCTRP47872 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCTRP47872 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCTRP47872 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCTRP47872 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCTRP47872 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCTRP47872 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCTRP47872 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCTRP47872 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCTRP47872 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCTRP47872 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCTRP47872 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCTRP47872 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCTRP47872 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCTRP47872 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCTRP47872 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCTRP47872 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCTRP47872 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCTRP47872 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCTRP47872 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCTRP47872 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCTRP47872 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCTRP47872 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCTRP47872 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCTRP47872 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCTRP47872 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCTRP47872 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCTRP47872 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms