Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN2P35609 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN2P35609 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTN2P35609 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms