Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ACTN2P35609 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ACTN2P35609 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ACTN2P35609 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ACTN2P35609 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ACTN2P35609 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ACTN2P35609 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ACTN2P35609 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ACTN2P35609 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ACTN2P35609 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ACTN2P35609 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ACTN2P35609 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ACTN2P35609 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ACTN2P35609 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ACTN2P35609 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ACTN2P35609 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ACTN2P35609 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACTN2P35609 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACTN2P35609 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ACTN2P35609 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ACTN2P35609 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ACTN2P35609 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ACTN2P35609 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ACTN2P35609 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ACTN2P35609 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ACTN2P35609 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ACTN2P35609 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ACTN2P35609 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ACTN2P35609 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ACTN2P35609 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ACTN2P35609 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ACTN2P35609 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ACTN2P35609 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ACTN2P35609 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ACTN2P35609 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ACTN2P35609 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ACTN2P35609 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ACTN2P35609 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ACTN2P35609 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ACTN2P35609 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ACTN2P35609 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ACTN2P35609 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ACTN2P35609 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACTN2P35609 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ACTN2P35609 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ACTN2P35609 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ACTN2P35609 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ACTN2P35609 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ACTN2P35609 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ACTN2P35609 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ACTN2P35609 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ACTN2P35609 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ACTN2P35609 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ACTN2P35609 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ACTN2P35609 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ACTN2P35609 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ACTN2P35609 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ACTN2P35609 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ACTN2P35609 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ACTN2P35609 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ACTN2P35609 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ACTN2P35609 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ACTN2P35609 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ACTN2P35609 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ACTN2P35609 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ACTN2P35609 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ACTN2P35609 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ACTN2P35609 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ACTN2P35609 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ACTN2P35609 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ACTN2P35609 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ACTN2P35609 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ACTN2P35609 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ACTN2P35609 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ACTN2P35609 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ACTN2P35609 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ACTN2P35609 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ACTN2P35609 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ACTN2P35609 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ACTN2P35609 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ACTN2P35609 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ACTN2P35609 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ACTN2P35609 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ACTN2P35609 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ACTN2P35609 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ACTN2P35609 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ACTN2P35609 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ACTN2P35609 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN2P35609 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ACTN2P35609 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ACTN2P35609 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ACTN2P35609 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ACTN2P35609 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ACTN2P35609 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ACTN2P35609 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ACTN2P35609 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ACTN2P35609 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ACTN2P35609 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ACTN2P35609 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN2P35609 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms