Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP1P32455 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP1P32455 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP1P32455 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP1P32455 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GBP1P32455 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP1P32455 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP1P32455 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP1P32455 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP1P32455 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP1P32455 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP1P32455 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP1P32455 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP1P32455 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP1P32455 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP1P32455 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP1P32455 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP1P32455 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP1P32455 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP1P32455 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP1P32455 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP1P32455 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP1P32455 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP1P32455 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP1P32455 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP1P32455 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP1P32455 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP1P32455 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP1P32455 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP1P32455 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP1P32455 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP1P32455 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP1P32455 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP1P32455 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP1P32455 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP1P32455 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP1P32455 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP1P32455 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP1P32455 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP1P32455 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP1P32455 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP1P32455 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP1P32455 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GBP1P32455 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP1P32455 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP1P32455 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GBP1P32455 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GBP1P32455 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP1P32455 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP1P32455 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP1P32455 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GBP1P32455 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GBP1P32455 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP1P32455 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP1P32455 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP1P32455 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GBP1P32455 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP1P32455 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP1P32455 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP1P32455 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GBP1P32455 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP1P32455 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP1P32455 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP1P32455 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP1P32455 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GBP1P32455 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP1P32455 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GBP1P32455 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP1P32455 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP1P32455 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GBP1P32455 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GBP1P32455 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms