Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC7A1P30825 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC7A1P30825 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC7A1P30825 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC7A1P30825 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms