Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPN1MW3P0DN78 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN1MW3P0DN78 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms