Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB5P09067 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXB5P09067 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXB5P09067 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXB5P09067 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms