Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3BMM0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3BMM0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3BMM0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BMM0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BMM0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BMM0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BMM0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3BMM0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3BMM0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3BMM0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMM0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMM0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMM0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3BMM0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3BMM0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BMM0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BMM0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H3BMM0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H3BMM0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMM0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMM0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMM0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMM0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H3BMM0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H3BMM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMM0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMM0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3BMM0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3BMM0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3BMM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMM0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMM0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMM0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H3BMM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H3BMM0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H3BMM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H3BMM0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms