Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD8B2A6NJW9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD8B2A6NJW9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8B2A6NJW9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1124.3 ms