Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CD8B2A6NJW9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CD8B2A6NJW9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CD8B2A6NJW9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CD8B2A6NJW9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD8B2A6NJW9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CD8B2A6NJW9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD8B2A6NJW9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CD8B2A6NJW9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD8B2A6NJW9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD8B2A6NJW9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD8B2A6NJW9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD8B2A6NJW9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD8B2A6NJW9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD8B2A6NJW9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD8B2A6NJW9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD8B2A6NJW9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD8B2A6NJW9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD8B2A6NJW9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD8B2A6NJW9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD8B2A6NJW9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD8B2A6NJW9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD8B2A6NJW9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD8B2A6NJW9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD8B2A6NJW9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD8B2A6NJW9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD8B2A6NJW9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD8B2A6NJW9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD8B2A6NJW9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD8B2A6NJW9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD8B2A6NJW9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD8B2A6NJW9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD8B2A6NJW9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD8B2A6NJW9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD8B2A6NJW9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD8B2A6NJW9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD8B2A6NJW9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD8B2A6NJW9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CD8B2A6NJW9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD8B2A6NJW9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CD8B2A6NJW9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CD8B2A6NJW9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD8B2A6NJW9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD8B2A6NJW9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD8B2A6NJW9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD8B2A6NJW9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD8B2A6NJW9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD8B2A6NJW9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD8B2A6NJW9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD8B2A6NJW9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CD8B2A6NJW9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CD8B2A6NJW9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD8B2A6NJW9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CD8B2A6NJW9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD8B2A6NJW9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD8B2A6NJW9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD8B2A6NJW9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD8B2A6NJW9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD8B2A6NJW9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD8B2A6NJW9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD8B2A6NJW9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD8B2A6NJW9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD8B2A6NJW9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD8B2A6NJW9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CD8B2A6NJW9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD8B2A6NJW9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CD8B2A6NJW9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD8B2A6NJW9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD8B2A6NJW9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD8B2A6NJW9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD8B2A6NJW9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD8B2A6NJW9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CD8B2A6NJW9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CD8B2A6NJW9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD8B2A6NJW9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CD8B2A6NJW9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD8B2A6NJW9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD8B2A6NJW9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CD8B2A6NJW9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD8B2A6NJW9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD8B2A6NJW9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD8B2A6NJW9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD8B2A6NJW9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD8B2A6NJW9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CD8B2A6NJW9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD8B2A6NJW9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD8B2A6NJW9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD8B2A6NJW9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD8B2A6NJW9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD8B2A6NJW9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD8B2A6NJW9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD8B2A6NJW9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms