Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GNB1P62873 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GNB1P62873 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms