RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.78■■■■□ 3.64
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.28■■■□□ 2.76
SPNS3-201ENST00000355530 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
SPNS3-201ENST00000355530 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.99■■■□□ 2.71
SPNS3-201ENST00000355530 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SPNS3-201ENST00000355530 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.15■■■□□ 2.58
SPNS3-201ENST00000355530 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.91■■■□□ 2.54
SPNS3-201ENST00000355530 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.7■■■□□ 2.5
SPNS3-201ENST00000355530 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.65■■■□□ 2.5
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC9O60706 1549 aa30.3■■■□□ 2.44
SPNS3-201ENST00000355530 SCRIBQ14160 1630 aa30.04■■■□□ 2.4
SPNS3-201ENST00000355530 HRCP23327 699 aa29.98■■■□□ 2.39
SPNS3-201ENST00000355530 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SPNS3-201ENST00000355530 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.77■■■□□ 2.36
SPNS3-201ENST00000355530 NACADO15069 1562 aa29.72■■■□□ 2.35
SPNS3-201ENST00000355530 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.68■■■□□ 2.34
SPNS3-201ENST00000355530 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.65■■■□□ 2.34
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM41Q8WV44 630 aa29.35■■■□□ 2.29
SPNS3-201ENST00000355530 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.33■■■□□ 2.29
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
SPNS3-201ENST00000355530 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS3-201ENST00000355530 WIZO95785 1651 aa29.19■■■□□ 2.26
SPNS3-201ENST00000355530 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SPNS3-201ENST00000355530 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SPNS3-201ENST00000355530 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SPNS3-201ENST00000355530 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SPNS3-201ENST00000355530 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCA4P51532 1647 aa28.81■■■□□ 2.2
SPNS3-201ENST00000355530 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.78■■■□□ 2.2
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCA2P51531 1590 aa28.64■■■□□ 2.17
SPNS3-201ENST00000355530 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.6■■■□□ 2.17
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.59■■■□□ 2.17
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC8Q09428 1581 aa28.52■■■□□ 2.16
SPNS3-201ENST00000355530 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS3-201ENST00000355530 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
SPNS3-201ENST00000355530 EEA1Q15075 1411 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS3-201ENST00000355530 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.32■■■□□ 2.12
SPNS3-201ENST00000355530 CEP162Q5TB80 1403 aa28.24■■■□□ 2.11
SPNS3-201ENST00000355530 SOGA1O94964 1423 aa28.23■■■□□ 2.11
SPNS3-201ENST00000355530 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.2■■■□□ 2.11
SPNS3-201ENST00000355530 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.07■■■□□ 2.08
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA3Q08378 1498 aa28.07■■■□□ 2.08
SPNS3-201ENST00000355530 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
SPNS3-201ENST00000355530 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.06■■■□□ 2.08
SPNS3-201ENST00000355530 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SPNS3-201ENST00000355530 SYNJ1O43426 1573 aa27.97■■■□□ 2.07
SPNS3-201ENST00000355530 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.95■■■□□ 2.07
SPNS3-201ENST00000355530 KIF21BO75037 1637 aa27.95■■■□□ 2.07
SPNS3-201ENST00000355530 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SPNS3-201ENST00000355530 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.91■■■□□ 2.06
SPNS3-201ENST00000355530 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SPNS3-201ENST00000355530 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SPNS3-201ENST00000355530 TOP2BQ02880 1626 aa27.69■■■□□ 2.02
SPNS3-201ENST00000355530 CLIP1P30622 1438 aa27.68■■■□□ 2.02
SPNS3-201ENST00000355530 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.64■■■□□ 2.02
SPNS3-201ENST00000355530 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS3-201ENST00000355530 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
SPNS3-201ENST00000355530 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.59■■■□□ 2.01
SPNS3-201ENST00000355530 HMGXB3Q12766 1538 aa27.54■■■□□ 2
SPNS3-201ENST00000355530 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
SPNS3-201ENST00000355530 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS3-201ENST00000355530 NCAPD3P42695 1498 aa27.43■■□□□ 1.98
SPNS3-201ENST00000355530 PRXQ9BXM0 1461 aa27.38■■□□□ 1.97
SPNS3-201ENST00000355530 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SPNS3-201ENST00000355530 APLP2Q06481 763 aa27.38■■□□□ 1.97
SPNS3-201ENST00000355530 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SPNS3-201ENST00000355530 CUX1P39880 1505 aa27.31■■□□□ 1.96
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SPNS3-201ENST00000355530 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SPNS3-201ENST00000355530 NEUROD1Q13562 356 aa27.26■■□□□ 1.96
SPNS3-201ENST00000355530 ARAP1Q96P48 1450 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS3-201ENST00000355530 CFTRP13569 1480 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS3-201ENST00000355530 PRDM2Q13029 1718 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS3-201ENST00000355530 KIF27Q86VH2 1401 aa27.22■■□□□ 1.95
SPNS3-201ENST00000355530 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SPNS3-201ENST00000355530 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS3-201ENST00000355530 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
SPNS3-201ENST00000355530 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.01■■□□□ 1.91
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS3-201ENST00000355530 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS3-201ENST00000355530 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SPNS3-201ENST00000355530 CUX2O14529 1486 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS3-201ENST00000355530 MIER1Q8N108 512 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS3-201ENST00000355530 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K1Q13233 1512 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS3-201ENST00000355530 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-201ENST00000355530 IGF1RP08069 1367 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS3-201ENST00000355530 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS3-201ENST00000355530 TIAM1Q13009 1591 aa26.8■■□□□ 1.88
SPNS3-201ENST00000355530 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SPNS3-201ENST00000355530 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-201ENST00000355530 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS3-201ENST00000355530 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS3-201ENST00000355530 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS3-201ENST00000355530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.61■■□□□ 1.85
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