Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNB1P62873 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNB1P62873 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GNB1P62873 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNB1P62873 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GNB1P62873 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GNB1P62873 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNB1P62873 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GNB1P62873 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNB1P62873 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNB1P62873 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GNB1P62873 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNB1P62873 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNB1P62873 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNB1P62873 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNB1P62873 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNB1P62873 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNB1P62873 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNB1P62873 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNB1P62873 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNB1P62873 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNB1P62873 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNB1P62873 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNB1P62873 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNB1P62873 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNB1P62873 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNB1P62873 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNB1P62873 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNB1P62873 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GNB1P62873 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GNB1P62873 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNB1P62873 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNB1P62873 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GNB1P62873 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GNB1P62873 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GNB1P62873 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNB1P62873 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNB1P62873 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNB1P62873 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNB1P62873 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNB1P62873 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNB1P62873 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNB1P62873 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNB1P62873 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNB1P62873 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNB1P62873 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNB1P62873 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNB1P62873 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNB1P62873 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNB1P62873 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNB1P62873 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNB1P62873 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNB1P62873 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNB1P62873 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNB1P62873 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNB1P62873 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNB1P62873 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNB1P62873 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNB1P62873 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNB1P62873 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNB1P62873 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNB1P62873 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNB1P62873 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNB1P62873 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNB1P62873 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNB1P62873 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNB1P62873 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNB1P62873 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNB1P62873 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNB1P62873 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNB1P62873 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNB1P62873 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNB1P62873 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNB1P62873 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNB1P62873 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNB1P62873 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNB1P62873 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNB1P62873 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNB1P62873 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNB1P62873 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNB1P62873 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GNB1P62873 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNB1P62873 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNB1P62873 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNB1P62873 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNB1P62873 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNB1P62873 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNB1P62873 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNB1P62873 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNB1P62873 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNB1P62873 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNB1P62873 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNB1P62873 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNB1P62873 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNB1P62873 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNB1P62873 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNB1P62873 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNB1P62873 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNB1P62873 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNB1P62873 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms