Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.498e-15■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 ARPC3-203ENST00000467622 1098 ntTSL 510.7□□□□□ -0.78e-15■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.48e-15■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.374e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.194e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-202ENST00000450573 479 ntTSL 215.5■□□□□ 0.073e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-203ENST00000467636 670 ntTSL 510.19□□□□□ -0.783e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-204ENST00000471009 670 ntTSL 28.38□□□□□ -1.073e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SAP18-206ENST00000492245 405 ntTSL 47.71□□□□□ -1.183e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-11■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-11■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-11■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.433e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.433e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SURF1-202ENST00000437995 813 ntTSL 523.38■■□□□ 1.333e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SURF1-204ENST00000495952 931 ntTSL 210.72□□□□□ -0.693e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.318e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.18e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 SUMF2-212ENST00000447501 1249 ntTSL 217.17■□□□□ 0.348e-7■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.191e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.581e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.931e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 513.64□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.248e-8■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.558e-8■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2B-208ENST00000478188 3093 ntTSL 25.05□□□□□ -1.68e-8■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.618e-8■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 TOP2A-202ENST00000577541 420 ntTSL 23.73□□□□□ -1.812e-14■■■□□ 17.7
PABPC4Q13310 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.067e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.877e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.677e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.547e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.427e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 COX7A2-207ENST00000481061 914 ntTSL 28.71□□□□□ -1.021e-11■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.845e-16■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-16■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 UBP1-212ENST00000492136 7394 ntTSL 27.28□□□□□ -1.245e-16■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 EHBP1L1-209ENST00000533364 769 ntTSL 223.45■■□□□ 1.343e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.347e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 CDC34-202ENST00000586283 1147 ntTSL 321.47■■□□□ 1.037e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 RPS25-204ENST00000527853 1462 ntTSL 221.71■■□□□ 1.079e-20■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.269e-20■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 RPS25-203ENST00000527791 711 ntTSL 215.13■□□□□ 0.019e-20■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 RPS25-206ENST00000532567 508 ntTSL 26.91□□□□□ -1.39e-20■■■□□ 17.6
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PABPC4Q13310 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.714e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-9■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-21■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATP6V1F-202ENST00000492758 711 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-21■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.024e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 KXD1-214ENST00000600654 895 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-9■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SNF8-204ENST00000506104 455 ntTSL 310.18□□□□□ -0.783e-11■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SNF8-210ENST00000511214 429 ntTSL 29.82□□□□□ -0.843e-11■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.318e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.724e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.334e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATG4D-208ENST00000588667 1619 ntTSL 1 (best)23.78■■□□□ 1.46e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.386e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATG4D-211ENST00000589753 931 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.426e-10■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ACSS2-210ENST00000476922 1527 ntTSL 222.23■■□□□ 1.155e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 522■■□□□ 1.115e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.795e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.315e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 210.79□□□□□ -0.685e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-9■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 DCXR-217ENST00000582613 617 ntTSL 231.39■■■□□ 2.621e-14■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 DCXR-219ENST00000584318 284 ntTSL 518.31■□□□□ 0.521e-14■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.063e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.183e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.564e-30■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.027e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 413.38□□□□□ -0.276e-22■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ARL6IP4-202ENST00000357866 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 UBA52-203ENST00000594527 357 ntTSL 38.04□□□□□ -1.127e-36■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 210.77□□□□□ -0.694e-9■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 PSMD2-218ENST00000491494 371 ntTSL 220.55■□□□□ 0.888e-13■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.836e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.846e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.431e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-8■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 RPL32-207ENST00000452606 631 ntTSL 27.84□□□□□ -1.153e-38■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.623e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 216.83■□□□□ 0.283e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 216.12■□□□□ 0.173e-7■■■□□ 17.6
PABPC4Q13310 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.273e-7■■■□□ 17.6
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