Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf51A6NDU8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf51A6NDU8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms