RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.36■■■■■ 4.53
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.98■■■■□ 3.67
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC9O60706 1549 aa36.74■■■■□ 3.47
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.29■■■■□ 3.4
PRRT1-201ENST00000211413 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
PRRT1-201ENST00000211413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.68■■■■□ 3.3
PRRT1-201ENST00000211413 NACADO15069 1562 aa35.54■■■■□ 3.28
PRRT1-201ENST00000211413 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.46■■■■□ 3.27
PRRT1-201ENST00000211413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.42■■■■□ 3.26
PRRT1-201ENST00000211413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.22■■■■□ 3.23
PRRT1-201ENST00000211413 SCRIBQ14160 1630 aa35.06■■■■□ 3.2
PRRT1-201ENST00000211413 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.83■■■■□ 3.17
PRRT1-201ENST00000211413 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.13
PRRT1-201ENST00000211413 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.47■■■■□ 3.11
PRRT1-201ENST00000211413 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.89■■■■□ 3.02
PRRT1-201ENST00000211413 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.57■■■□□ 2.96
PRRT1-201ENST00000211413 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PRRT1-201ENST00000211413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
PRRT1-201ENST00000211413 SMARCA4P51532 1647 aa33.47■■■□□ 2.95
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
PRRT1-201ENST00000211413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.94
PRRT1-201ENST00000211413 WIZO95785 1651 aa33.29■■■□□ 2.92
PRRT1-201ENST00000211413 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.16■■■□□ 2.9
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.1■■■□□ 2.89
PRRT1-201ENST00000211413 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.09■■■□□ 2.89
PRRT1-201ENST00000211413 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.99■■■□□ 2.87
PRRT1-201ENST00000211413 SMARCA2P51531 1590 aa32.96■■■□□ 2.87
PRRT1-201ENST00000211413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
PRRT1-201ENST00000211413 NCAPD3P42695 1498 aa32.85■■■□□ 2.85
PRRT1-201ENST00000211413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
PRRT1-201ENST00000211413 HMGXB3Q12766 1538 aa32.7■■■□□ 2.83
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.54■■■□□ 2.8
PRRT1-201ENST00000211413 NESP48681 1621 aa32.09■■■□□ 2.73
PRRT1-201ENST00000211413 CADPSQ9ULU8 1353 aa32■■■□□ 2.71
PRRT1-201ENST00000211413 CFTRP13569 1480 aa31.96■■■□□ 2.71
PRRT1-201ENST00000211413 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.81■■■□□ 2.68
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC8Q09428 1581 aa31.73■■■□□ 2.67
PRRT1-201ENST00000211413 PRDM2Q13029 1718 aa31.72■■■□□ 2.67
PRRT1-201ENST00000211413 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.68■■■□□ 2.66
PRRT1-201ENST00000211413 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.68■■■□□ 2.66
PRRT1-201ENST00000211413 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.63■■■□□ 2.65
PRRT1-201ENST00000211413 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.6■■■□□ 2.65
PRRT1-201ENST00000211413 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.51■■■□□ 2.63
PRRT1-201ENST00000211413 ERCC6Q03468 1493 aa31.48■■■□□ 2.63
PRRT1-201ENST00000211413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.47■■■□□ 2.63
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM41Q8WV44 630 aa31.45■■■□□ 2.63
PRRT1-201ENST00000211413 SYNJ1O43426 1573 aa31.43■■■□□ 2.62
PRRT1-201ENST00000211413 CUX1P39880 1505 aa31.4■■■□□ 2.62
PRRT1-201ENST00000211413 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
PRRT1-201ENST00000211413 TOPBP1Q92547 1522 aa31.27■■■□□ 2.6
PRRT1-201ENST00000211413 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.26■■■□□ 2.59
PRRT1-201ENST00000211413 TOP2BQ02880 1626 aa31.25■■■□□ 2.59
PRRT1-201ENST00000211413 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.22■■■□□ 2.59
PRRT1-201ENST00000211413 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.22■■■□□ 2.59
PRRT1-201ENST00000211413 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
PRRT1-201ENST00000211413 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.15■■■□□ 2.58
PRRT1-201ENST00000211413 WDR62O43379 1518 aa31.1■■■□□ 2.57
PRRT1-201ENST00000211413 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
PRRT1-201ENST00000211413 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.07■■■□□ 2.56
PRRT1-201ENST00000211413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
PRRT1-201ENST00000211413 SOGA1O94964 1423 aa31■■■□□ 2.55
PRRT1-201ENST00000211413 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.98■■■□□ 2.55
PRRT1-201ENST00000211413 CUX2O14529 1486 aa30.96■■■□□ 2.55
PRRT1-201ENST00000211413 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PRRT1-201ENST00000211413 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.78■■■□□ 2.52
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
PRRT1-201ENST00000211413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.77■■■□□ 2.52
PRRT1-201ENST00000211413 WDR97A6NE52 1622 aa30.75■■■□□ 2.51
PRRT1-201ENST00000211413 IFT140Q96RY7 1462 aa30.75■■■□□ 2.51
PRRT1-201ENST00000211413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
PRRT1-201ENST00000211413 KIF27Q86VH2 1401 aa30.69■■■□□ 2.5
PRRT1-201ENST00000211413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.63■■■□□ 2.49
PRRT1-201ENST00000211413 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.6■■■□□ 2.49
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.6■■■□□ 2.49
PRRT1-201ENST00000211413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.59■■■□□ 2.49
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PRRT1-201ENST00000211413 IGF1RP08069 1367 aa30.56■■■□□ 2.48
PRRT1-201ENST00000211413 EEA1Q15075 1411 aa30.53■■■□□ 2.48
PRRT1-201ENST00000211413 PBRM1Q86U86 1689 aa30.48■■■□□ 2.47
PRRT1-201ENST00000211413 GRIN2BQ13224 1484 aa30.42■■■□□ 2.46
PRRT1-201ENST00000211413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.38■■■□□ 2.45
PRRT1-201ENST00000211413 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
PRRT1-201ENST00000211413 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.37■■■□□ 2.45
PRRT1-201ENST00000211413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.35■■■□□ 2.45
PRRT1-201ENST00000211413 PRXQ9BXM0 1461 aa30.34■■■□□ 2.45
PRRT1-201ENST00000211413 FBLN2P98095 1184 aa30.28■■■□□ 2.44
PRRT1-201ENST00000211413 KIF21BO75037 1637 aa30.26■■■□□ 2.43
PRRT1-201ENST00000211413 CUL7Q14999 1698 aa30.26■■■□□ 2.43
PRRT1-201ENST00000211413 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS12P58397 1594 aa30.25■■■□□ 2.43
PRRT1-201ENST00000211413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.21■■■□□ 2.43
PRRT1-201ENST00000211413 GOLGA3Q08378 1498 aa30.2■■■□□ 2.42
PRRT1-201ENST00000211413 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PRRT1-201ENST00000211413 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PRRT1-201ENST00000211413 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PRRT1-201ENST00000211413 SYNJ2O15056 1496 aa30.12■■■□□ 2.41
PRRT1-201ENST00000211413 CHD1O14646 1710 aa30.07■■■□□ 2.4
PRRT1-201ENST00000211413 GRIN2AQ12879 1464 aa30.07■■■□□ 2.4
PRRT1-201ENST00000211413 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.99■■■□□ 2.39
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