Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLK1P49759 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLK1P49759 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLK1P49759 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLK1P49759 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms