Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GNB1P62873 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms