RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.06■■■■■ 5.44
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.99■■■■■ 4.63
CXCL3-201ENST00000296026 ABCC9O60706 1549 aa43.92■■■■■ 4.62
CXCL3-201ENST00000296026 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.83■■■■■ 4.29
CXCL3-201ENST00000296026 NACADO15069 1562 aa41.56■■■■■ 4.24
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.41■■■■■ 4.22
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.12■■■■■ 4.17
CXCL3-201ENST00000296026 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.01■■■■■ 4.16
CXCL3-201ENST00000296026 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
CXCL3-201ENST00000296026 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.89■■■■■ 4.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CXCL3-201ENST00000296026 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.61■■■■■ 4.09
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.52■■■■■ 4.08
CXCL3-201ENST00000296026 SCRIBQ14160 1630 aa40.09■■■■■ 4.01
CXCL3-201ENST00000296026 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.05■■■■■ 4
CXCL3-201ENST00000296026 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.67■■■■□ 3.94
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.61■■■■□ 3.93
CXCL3-201ENST00000296026 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.55■■■■□ 3.92
CXCL3-201ENST00000296026 NCAPD3P42695 1498 aa38.37■■■■□ 3.73
CXCL3-201ENST00000296026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.27■■■■□ 3.72
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCA4P51532 1647 aa38.26■■■■□ 3.71
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCA2P51531 1590 aa38.17■■■■□ 3.7
CXCL3-201ENST00000296026 HMGXB3Q12766 1538 aa38.09■■■■□ 3.69
CXCL3-201ENST00000296026 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
CXCL3-201ENST00000296026 ERCC6Q03468 1493 aa37.91■■■■□ 3.66
CXCL3-201ENST00000296026 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
CXCL3-201ENST00000296026 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.87■■■■□ 3.65
CXCL3-201ENST00000296026 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.81■■■■□ 3.64
CXCL3-201ENST00000296026 CUX2O14529 1486 aa37.8■■■■□ 3.64
CXCL3-201ENST00000296026 NESP48681 1621 aa37.75■■■■□ 3.63
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.69■■■■□ 3.62
CXCL3-201ENST00000296026 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.5■■■■□ 3.59
CXCL3-201ENST00000296026 WIZO95785 1651 aa37.37■■■■□ 3.57
CXCL3-201ENST00000296026 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
CXCL3-201ENST00000296026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.27■■■■□ 3.56
CXCL3-201ENST00000296026 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.27■■■■□ 3.56
CXCL3-201ENST00000296026 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.21■■■■□ 3.55
CXCL3-201ENST00000296026 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
CXCL3-201ENST00000296026 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.95■■■■□ 3.51
CXCL3-201ENST00000296026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CXCL3-201ENST00000296026 WDR62O43379 1518 aa36.85■■■■□ 3.49
CXCL3-201ENST00000296026 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.82■■■■□ 3.49
CXCL3-201ENST00000296026 CFTRP13569 1480 aa36.8■■■■□ 3.48
CXCL3-201ENST00000296026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.79■■■■□ 3.48
CXCL3-201ENST00000296026 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.48■■■■□ 3.43
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM2Q13029 1718 aa36.44■■■■□ 3.42
CXCL3-201ENST00000296026 TOPBP1Q92547 1522 aa36.11■■■■□ 3.37
CXCL3-201ENST00000296026 OSCARQ8IYS5 282 aa36.1■■■■□ 3.37
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM41Q8WV44 630 aa36.09■■■■□ 3.37
CXCL3-201ENST00000296026 IFT140Q96RY7 1462 aa36.08■■■■□ 3.37
CXCL3-201ENST00000296026 ABCC8Q09428 1581 aa36.03■■■■□ 3.36
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
CXCL3-201ENST00000296026 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.98■■■■□ 3.35
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
CXCL3-201ENST00000296026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
CXCL3-201ENST00000296026 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
CXCL3-201ENST00000296026 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.313e-7■■■■■ 36.6
CXCL3-201ENST00000296026 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.62■■■■□ 3.29
CXCL3-201ENST00000296026 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.62■■■■□ 3.29
CXCL3-201ENST00000296026 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.62■■■■□ 3.29
CXCL3-201ENST00000296026 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.61■■■■□ 3.29
CXCL3-201ENST00000296026 SOGA1O94964 1423 aa35.58■■■■□ 3.29
CXCL3-201ENST00000296026 CHD1O14646 1710 aa35.55■■■■□ 3.28
CXCL3-201ENST00000296026 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF11O15085 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
CXCL3-201ENST00000296026 CUX1P39880 1505 aa35.52■■■■□ 3.28
CXCL3-201ENST00000296026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CXCL3-201ENST00000296026 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CXCL3-201ENST00000296026 FBLN2P98095 1184 aa35.48■■■■□ 3.27
CXCL3-201ENST00000296026 WDR97A6NE52 1622 aa35.4■■■■□ 3.26
CXCL3-201ENST00000296026 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.35■■■■□ 3.25
CXCL3-201ENST00000296026 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.26■■■■□ 3.24
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN2BQ13224 1484 aa35.26■■■■□ 3.23
CXCL3-201ENST00000296026 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CXCL3-201ENST00000296026 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CXCL3-201ENST00000296026 ARAP1Q96P48 1450 aa35.17■■■■□ 3.22
CXCL3-201ENST00000296026 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.16■■■■□ 3.22
CXCL3-201ENST00000296026 SYNJ2O15056 1496 aa35.14■■■■□ 3.22
CXCL3-201ENST00000296026 PBRM1Q86U86 1689 aa35.14■■■■□ 3.22
CXCL3-201ENST00000296026 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.13■■■■□ 3.21
CXCL3-201ENST00000296026 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.13■■■■□ 3.21
CXCL3-201ENST00000296026 SYNJ1O43426 1573 aa35.13■■■■□ 3.21
CXCL3-201ENST00000296026 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.07■■■■□ 3.21
CXCL3-201ENST00000296026 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.2
CXCL3-201ENST00000296026 TOP2BQ02880 1626 aa34.97■■■■□ 3.19
CXCL3-201ENST00000296026 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.97■■■■□ 3.19
CXCL3-201ENST00000296026 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN2AQ12879 1464 aa34.81■■■■□ 3.16
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS12P58397 1594 aa34.8■■■■□ 3.16
CXCL3-201ENST00000296026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.71■■■■□ 3.15
CXCL3-201ENST00000296026 NUP160Q12769 1436 aa34.69■■■■□ 3.14
CXCL3-201ENST00000296026 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.69■■■■□ 3.14
CXCL3-201ENST00000296026 CEP170Q5SW79 1584 aa34.69■■■■□ 3.14
CXCL3-201ENST00000296026 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.61■■■■□ 3.13
CXCL3-201ENST00000296026 SHROOM2Q13796 1616 aa34.52■■■■□ 3.12
CXCL3-201ENST00000296026 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CXCL3-201ENST00000296026 JPH4Q96JJ6 628 aa34.34■■■■□ 3.09
CXCL3-201ENST00000296026 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.31■■■■□ 3.08
CXCL3-201ENST00000296026 KIF27Q86VH2 1401 aa34.3■■■■□ 3.08
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