Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRPF8Q6P2Q9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 33.3
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PRPF8Q6P2Q9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-12■■■■■ 33.3
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PRPF8Q6P2Q9 METTL17-223ENST00000557279 730 ntTSL 39.39□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 33.3
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PRPF8Q6P2Q9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 04e-15■■■■■ 33.3
PRPF8Q6P2Q9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.34e-15■■■■■ 33.3
PRPF8Q6P2Q9 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.934e-15■■■■■ 33.3
PRPF8Q6P2Q9 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.764e-15■■■■■ 33.3
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