Protein–RNA interactions for Protein: Q9P287

BCCIP, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCCIPQ9P287 EHBP1-208ENST00000427809 581 ntTSL 45.97□□□□□ -1.457e-7■■■□□ 15
BCCIPQ9P287 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)5.36□□□□□ -1.557e-7■■■□□ 15
BCCIPQ9P287 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 15
BCCIPQ9P287 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 15
BCCIPQ9P287 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 15
BCCIPQ9P287 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 15
BCCIPQ9P287 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 525.66■■□□□ 1.74e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 325.66■■□□□ 1.74e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.64e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-204ENST00000553943 736 ntTSL 318.61■□□□□ 0.574e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.074e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-206ENST00000554681 759 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-207ENST00000556111 728 ntTSL 312.43□□□□□ -0.424e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.434e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 510.89□□□□□ -0.674e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.834e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.864e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.864e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.964e-8■■■□□ 14.8
BCCIPQ9P287 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 27.97□□□□□ -1.131e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.311e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SUPT3H-204ENST00000459689 396 ntTSL 24.25□□□□□ -1.731e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)23.26■■□□□ 1.311e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 14.6
BCCIPQ9P287 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.017e-8■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 220.73■□□□□ 0.917e-8■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.717e-8■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 USP10-211ENST00000564566 561 ntTSL 418.14■□□□□ 0.497e-8■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.427e-8■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 55.06□□□□□ -1.67e-8■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 217.93■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -12e-6■■□□□ 14.5
BCCIPQ9P287 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 522.31■■□□□ 1.168e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.988e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.428e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 217.51■□□□□ 0.398e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 216.86■□□□□ 0.298e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 416.32■□□□□ 0.28e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.188e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 315.45■□□□□ 0.068e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 514.96□□□□□ -0.018e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 214.96□□□□□ -0.018e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 413.6□□□□□ -0.238e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 413.05□□□□□ -0.328e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 511.45□□□□□ -0.588e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 211.27□□□□□ -0.618e-7■■□□□ 14.4
BCCIPQ9P287 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 517.35■□□□□ 0.377e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.095e-7■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-202ENST00000413551 698 ntTSL 515.06■□□□□ 07e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 513.78□□□□□ -0.27e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 MTUS1-225ENST00000523718 3354 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.355e-7■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 412.37□□□□□ -0.437e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 512.31□□□□□ -0.447e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.667e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.257e-8■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.465e-7■■□□□ 14.2
BCCIPQ9P287 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.312e-12■■□□□ 14.1
BCCIPQ9P287 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-14■■□□□ 14
BCCIPQ9P287 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.642e-14■■□□□ 14
BCCIPQ9P287 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-14■■□□□ 14
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BCCIPQ9P287 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 316.75■□□□□ 0.273e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.243e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 516.33■□□□□ 0.23e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.133e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-213ENST00000468928 900 ntTSL 314.99□□□□□ -0.013e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-202ENST00000412557 506 ntTSL 312.02□□□□□ -0.493e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 311.74□□□□□ -0.533e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 511.48□□□□□ -0.573e-7■■□□□ 13.9
BCCIPQ9P287 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC6.12□□□□□ -1.431e-15■■□□□ 13.7
BCCIPQ9P287 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 414.09□□□□□ -0.157e-6■■□□□ 13.7
BCCIPQ9P287 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 314.07□□□□□ -0.167e-6■■□□□ 13.7
BCCIPQ9P287 USP10-208ENST00000563386 590 ntTSL 419.64■□□□□ 0.733e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 219.36■□□□□ 0.693e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-210ENST00000563892 570 ntTSL 318.2■□□□□ 0.53e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-216ENST00000569511 571 ntTSL 518.2■□□□□ 0.53e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-203ENST00000562092 254 ntTSL 518.2■□□□□ 0.53e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-204ENST00000562283 569 ntTSL 417.4■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 311.54□□□□□ -0.563e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 35.57□□□□□ -1.523e-6■■□□□ 13.6
BCCIPQ9P287 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 530.88■■■□□ 2.532e-7■■□□□ 13.5
BCCIPQ9P287 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-7■■□□□ 13.5
BCCIPQ9P287 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)20.06■□□□□ 0.82e-7■■□□□ 13.5
BCCIPQ9P287 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-7■■□□□ 13.5
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