RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46■■■■■ 4.95
USP10-208ENST00000563386 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.92■■■■■ 4.14
USP10-208ENST00000563386 ABCC9O60706 1549 aa40.34■■■■■ 4.05
USP10-208ENST00000563386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.74■■■■□ 3.79
USP10-208ENST00000563386 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.65■■■■□ 3.78
USP10-208ENST00000563386 NACADO15069 1562 aa38.52■■■■□ 3.76
USP10-208ENST00000563386 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
USP10-208ENST00000563386 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.15■■■■□ 3.7
USP10-208ENST00000563386 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.96■■■■□ 3.67
USP10-208ENST00000563386 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.76■■■■□ 3.64
USP10-208ENST00000563386 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.71■■■■□ 3.63
USP10-208ENST00000563386 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.46■■■■□ 3.59
USP10-208ENST00000563386 SCRIBQ14160 1630 aa37.45■■■■□ 3.59
USP10-208ENST00000563386 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.15■■■■□ 3.54
USP10-208ENST00000563386 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.95■■■■□ 3.51
USP10-208ENST00000563386 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
USP10-208ENST00000563386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.41■■■■□ 3.42
USP10-208ENST00000563386 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.22■■■■□ 3.39
USP10-208ENST00000563386 SMARCA4P51532 1647 aa35.74■■■■□ 3.31
USP10-208ENST00000563386 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
USP10-208ENST00000563386 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.58■■■■□ 3.29
USP10-208ENST00000563386 NCAPD3P42695 1498 aa35.54■■■■□ 3.28
USP10-208ENST00000563386 SMARCA2P51531 1590 aa35.52■■■■□ 3.28
USP10-208ENST00000563386 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.48■■■■□ 3.27
USP10-208ENST00000563386 HMGXB3Q12766 1538 aa35.35■■■■□ 3.25
USP10-208ENST00000563386 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
USP10-208ENST00000563386 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.3■■■■□ 3.24
USP10-208ENST00000563386 WIZO95785 1651 aa35.11■■■■□ 3.21
USP10-208ENST00000563386 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
USP10-208ENST00000563386 NESP48681 1621 aa34.84■■■■□ 3.17
USP10-208ENST00000563386 ERCC6Q03468 1493 aa34.78■■■■□ 3.16
USP10-208ENST00000563386 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
USP10-208ENST00000563386 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.64■■■■□ 3.14
USP10-208ENST00000563386 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.54■■■■□ 3.12
USP10-208ENST00000563386 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.46■■■■□ 3.11
USP10-208ENST00000563386 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.41■■■■□ 3.1
USP10-208ENST00000563386 CUX2O14529 1486 aa34.36■■■■□ 3.09
USP10-208ENST00000563386 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.32■■■■□ 3.08
USP10-208ENST00000563386 CFTRP13569 1480 aa34.27■■■■□ 3.08
USP10-208ENST00000563386 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
USP10-208ENST00000563386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
USP10-208ENST00000563386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.17■■■■□ 3.06
USP10-208ENST00000563386 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.14■■■■□ 3.06
USP10-208ENST00000563386 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.12■■■■□ 3.05
USP10-208ENST00000563386 PRDM2Q13029 1718 aa34■■■■□ 3.03
USP10-208ENST00000563386 WDR62O43379 1518 aa33.96■■■■□ 3.03
USP10-208ENST00000563386 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
USP10-208ENST00000563386 TOPBP1Q92547 1522 aa33.59■■■□□ 2.97
USP10-208ENST00000563386 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.57■■■□□ 2.96
USP10-208ENST00000563386 ABCC8Q09428 1581 aa33.54■■■□□ 2.96
USP10-208ENST00000563386 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.53■■■□□ 2.96
USP10-208ENST00000563386 IFT140Q96RY7 1462 aa33.41■■■□□ 2.94
USP10-208ENST00000563386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
USP10-208ENST00000563386 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
USP10-208ENST00000563386 CUX1P39880 1505 aa33.29■■■□□ 2.92
USP10-208ENST00000563386 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
USP10-208ENST00000563386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.22■■■□□ 2.91
USP10-208ENST00000563386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.21■■■□□ 2.91
USP10-208ENST00000563386 SOGA1O94964 1423 aa33.2■■■□□ 2.91
USP10-208ENST00000563386 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
USP10-208ENST00000563386 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.13■■■□□ 2.894e-6■■□□□ 14.3
USP10-208ENST00000563386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
USP10-208ENST00000563386 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.03■■■□□ 2.88
USP10-208ENST00000563386 OSCARQ8IYS5 282 aa33■■■□□ 2.87
USP10-208ENST00000563386 SYNJ1O43426 1573 aa32.96■■■□□ 2.87
USP10-208ENST00000563386 TOP2BQ02880 1626 aa32.95■■■□□ 2.86
USP10-208ENST00000563386 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.93■■■□□ 2.86
USP10-208ENST00000563386 WDR97A6NE52 1622 aa32.88■■■□□ 2.85
USP10-208ENST00000563386 FBLN2P98095 1184 aa32.88■■■□□ 2.85
USP10-208ENST00000563386 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.84■■■□□ 2.85
USP10-208ENST00000563386 GRIN2BQ13224 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
USP10-208ENST00000563386 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.8■■■□□ 2.84
USP10-208ENST00000563386 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.8■■■□□ 2.84
USP10-208ENST00000563386 CHD1O14646 1710 aa32.79■■■□□ 2.84
USP10-208ENST00000563386 PBRM1Q86U86 1689 aa32.72■■■□□ 2.83
USP10-208ENST00000563386 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.72■■■□□ 2.83
USP10-208ENST00000563386 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
USP10-208ENST00000563386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
USP10-208ENST00000563386 SYNJ2O15056 1496 aa32.59■■■□□ 2.81
USP10-208ENST00000563386 TRIM41Q8WV44 630 aa32.53■■■□□ 2.8
USP10-208ENST00000563386 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
USP10-208ENST00000563386 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
USP10-208ENST00000563386 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
USP10-208ENST00000563386 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.44■■■□□ 2.78
USP10-208ENST00000563386 ADAMTS12P58397 1594 aa32.44■■■□□ 2.78
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF11O15085 1522 aa32.42■■■□□ 2.78
USP10-208ENST00000563386 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.39■■■□□ 2.78
USP10-208ENST00000563386 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.37■■■□□ 2.77
USP10-208ENST00000563386 GRIN2AQ12879 1464 aa32.37■■■□□ 2.77
USP10-208ENST00000563386 KIF27Q86VH2 1401 aa32.35■■■□□ 2.77
USP10-208ENST00000563386 IGF1RP08069 1367 aa32.24■■■□□ 2.75
USP10-208ENST00000563386 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.23■■■□□ 2.75
USP10-208ENST00000563386 CEP170Q5SW79 1584 aa32.23■■■□□ 2.75
USP10-208ENST00000563386 NUP160Q12769 1436 aa32.19■■■□□ 2.74
USP10-208ENST00000563386 ARAP1Q96P48 1450 aa32.15■■■□□ 2.74
USP10-208ENST00000563386 CUL7Q14999 1698 aa32.13■■■□□ 2.73
USP10-208ENST00000563386 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.07■■■□□ 2.72
USP10-208ENST00000563386 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.06■■■□□ 2.72
USP10-208ENST00000563386 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.98■■■□□ 2.71
USP10-208ENST00000563386 SHROOM2Q13796 1616 aa31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms