Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 UPF3A-203ENST00000474056 748 ntTSL 317.99■□□□□ 0.472e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 UPF3A-206ENST00000480362 965 ntTSL 517.94■□□□□ 0.462e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 UPF3A-208ENST00000484246 699 ntTSL 316.03■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 UPF3A-210ENST00000493727 937 ntTSL 512.23□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 FBXO9-203ENST00000370939 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 FBXO9-207ENST00000473318 574 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 FBXO9-209ENST00000474457 2913 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.292e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.452e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 FBXO9-211ENST00000484436 634 ntTSL 53.74□□□□□ -1.812e-10■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 SCRIB-204ENST00000525051 1685 ntTSL 1 (best)19.22■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 SPIRE2-204ENST00000562029 2215 ntTSL 218.81■□□□□ 0.63e-8■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 SPIRE2-210ENST00000569108 2409 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 SPIRE2-208ENST00000565628 505 ntTSL 314.76□□□□□ -0.053e-8■■■■■ 44.4
RBM22Q9NW64 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.111e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 UBP1-205ENST00000456378 581 ntTSL 423.85■■□□□ 1.411e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 MAGI1-212ENST00000480729 568 ntTSL 223.38■■□□□ 1.332e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 COL27A1-208ENST00000494780 514 ntTSL 423.1■■□□□ 1.292e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.152e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 220.35■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF4G1-233ENST00000475721 1271 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 519.1■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 218.94■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GGNBP2-216ENST00000618837 2346 ntTSL 218.66■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 SMPD4-210ENST00000441135 699 ntTSL 418.32■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 AKT2-225ENST00000496089 982 ntTSL 518.04■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GGNBP2-214ENST00000616019 695 ntTSL 217.94■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-213ENST00000467661 1707 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-214ENST00000491781 1533 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-212ENST00000463820 2495 ntTSL 216.91■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-209ENST00000453740 738 ntTSL 316.32■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 LMO7-217ENST00000525914 874 ntTSL 514.53□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GGNBP2-215ENST00000617860 3497 ntTSL 214.47□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 LMO7-214ENST00000524651 914 ntTSL 313.8□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-212ENST00000529321 1059 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 CCDC58-207ENST00000498466 683 ntTSL 213.7□□□□□ -0.221e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 ARHGAP17-215ENST00000575283 2213 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-202ENST00000415314 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.23□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EEPD1-204ENST00000487069 612 ntTSL 312.85□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 512.84□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RPL11-203ENST00000458455 721 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 LMO7-204ENST00000377499 3472 ntTSL 211.88□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-207ENST00000527790 625 ntTSL 311.83□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 AKT2-226ENST00000497948 456 ntTSL 311.65□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-215ENST00000492283 606 ntTSL 511.61□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 INTS10-216ENST00000523772 777 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 INTS10-206ENST00000520670 623 ntTSL 511.35□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 NCAPD2-209ENST00000539885 558 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EEPD1-203ENST00000468591 570 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 INTS10-209ENST00000521008 572 ntTSL 311.02□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-203ENST00000438976 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-201ENST00000368232 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF4G1-211ENST00000422614 750 ntTSL 510.52□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 OSMR-205ENST00000513831 766 ntTSL 310.49□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 AKT2-222ENST00000489375 734 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-204ENST00000463513 857 ntTSL 310.15□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 CCDC58-201ENST00000291458 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 CCDC58-206ENST00000497726 438 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-222ENST00000480982 2493 ntTSL 29.71□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 LMO7-206ENST00000447038 3165 ntTSL 29.51□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 ARHGAP17-210ENST00000572314 4966 ntTSL 28.97□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)8.97□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -12e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 LMO7-211ENST00000485987 1087 ntTSL 58.59□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-213ENST00000529575 780 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 INTS10-207ENST00000520827 631 ntTSL 38.42□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-207ENST00000494414 740 ntTSL 58.37□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-206ENST00000428519 583 ntTSL 48.26□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-214ENST00000529520 552 ntTSL 28.16□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 27.98□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 AKT2-215ENST00000476247 488 ntTSL 37.67□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-208ENST00000497287 837 ntTSL 37.46□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-203ENST00000524548 407 ntTSL 37.38□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-205ENST00000473910 2464 ntTSL 27.28□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 GPATCH4-209ENST00000498641 534 ntTSL 37.27□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-216ENST00000447863 3954 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 UBP1-213ENST00000496310 544 ntTSL 46.94□□□□□ -1.31e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-204ENST00000525597 577 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-227ENST00000579677 3915 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-203ENST00000412139 4460 ntTSL 25.21□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 44.3
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