Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 420.85■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.619e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.75■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 50.9
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-204ENST00000400790 2887 ntTSL 317.8■□□□□ 0.447e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-216ENST00000636426 1489 ntTSL 516.39■□□□□ 0.217e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-227ENST00000637568 4610 ntTSL 515.19■□□□□ 0.027e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-223ENST00000637015 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.44□□□□□ -0.17e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-230ENST00000637810 5073 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.117e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-212ENST00000635957 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.25□□□□□ -0.457e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-210ENST00000635849 5830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.637e-19■■■■■ 50.8
DROSHAQ9NRR4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.516e-13■■■■■ 50.7
DROSHAQ9NRR4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.859e-9■■■■■ 50.5
DROSHAQ9NRR4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.683e-7■■■■■ 50.2
DROSHAQ9NRR4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 50.2
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.326e-9■■■■■ 49.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-211ENST00000493362 868 ntTSL 27.37□□□□□ -1.236e-9■■■■■ 49.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-208ENST00000481820 957 ntTSL 27.31□□□□□ -1.246e-9■■■■■ 49.8
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-210ENST00000492865 528 ntTSL 24.15□□□□□ -1.746e-9■■■■■ 49.8
DROSHAQ9NRR4 TSC2-226ENST00000569930 2621 ntTSL 225.82■■□□□ 1.721e-7■■■■■ 49.8
DROSHAQ9NRR4 TSC2-225ENST00000569110 1687 ntTSL 525.16■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 49.8
DROSHAQ9NRR4 SPACA6-207ENST00000573266 1960 ntTSL 227.89■■■□□ 2.066e-8■■■■■ 49.7
DROSHAQ9NRR4 SPACA6-210ENST00000576093 1894 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 49.7
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 49.7
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 49.7
DROSHAQ9NRR4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.171e-6■■■■■ 49.6
DROSHAQ9NRR4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 49.6
DROSHAQ9NRR4 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 523.94■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 49.6
DROSHAQ9NRR4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.559e-9■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.839e-9■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.479e-9■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.399e-9■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.879e-9■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.264e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 GALNS-209ENST00000567525 1953 ntTSL 220.6■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 320.12■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 219.8■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 GALNS-203ENST00000562593 5682 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 CLCF1-202ENST00000533438 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 49.5
DROSHAQ9NRR4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.987e-10■■■■■ 49.4
DROSHAQ9NRR4 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 49.4
DROSHAQ9NRR4 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.417e-10■■■■■ 49.4
DROSHAQ9NRR4 ABCC5-206ENST00000437205 5852 ntTSL 511.09□□□□□ -0.637e-10■■■■■ 49.4
DROSHAQ9NRR4 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 49.3
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-204ENST00000578172 3927 nt18.26■□□□□ 0.513e-11■■■■■ 49.1
DROSHAQ9NRR4 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.116e-10■■■■■ 48.9
DROSHAQ9NRR4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.331e-14■■■■■ 48.7
DROSHAQ9NRR4 PLXNB2-203ENST00000425954 609 ntTSL 226.68■■□□□ 1.864e-7■■■■■ 48.3
DROSHAQ9NRR4 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 432.11■■■□□ 2.732e-9■■■■■ 48.3
DROSHAQ9NRR4 FADS1-218ENST00000544696 567 ntTSL 329.73■■■□□ 2.352e-9■■■■■ 48.3
DROSHAQ9NRR4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.072e-9■■■■■ 48.3
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DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-211ENST00000444822 724 ntTSL 324.6■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-212ENST00000460677 1393 ntTSL 1 (best)24■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-202ENST00000411591 1084 ntTSL 323.32■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-214ENST00000473978 1430 ntTSL 1 (best)21.24■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-216ENST00000491544 589 ntTSL 316.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 48.1
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DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-205ENST00000430755 798 ntTSL 315.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-203ENST00000412869 499 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 PCYT1A-208ENST00000438634 555 ntTSL 43.76□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 48.1
DROSHAQ9NRR4 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.122e-45■■■■■ 47.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 414.55□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 47.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 38.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 47.9
DROSHAQ9NRR4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.542e-10■■■■■ 47.7
DROSHAQ9NRR4 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-9■■■■■ 47.2
DROSHAQ9NRR4 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.682e-19■■■■■ 47.2
DROSHAQ9NRR4 SKA2-210ENST00000584089 229 ntTSL 41.73□□□□□ -2.136e-16■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.056e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.316e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-205ENST00000355657 2617 ntTSL 228.96■■■□□ 2.236e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.716e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-201ENST00000239117 555 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 06e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-212ENST00000472764 847 ntTSL 512.72□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 47.1
DROSHAQ9NRR4 GABBR1-210ENST00000476670 487 ntTSL 432.78■■■□□ 2.844e-7■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.432e-7■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 432.53■■■□□ 2.82e-7■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-219ENST00000512325 577 ntTSL 332.53■■■□□ 2.82e-7■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 532.08■■■□□ 2.732e-7■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-202ENST00000502656 554 ntTSL 430.01■■■□□ 2.392e-7■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 46.9
DROSHAQ9NRR4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.244e-8■■■■■ 46.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 327.25■■□□□ 1.954e-8■■■■■ 46.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.584e-8■■■■■ 46.7
DROSHAQ9NRR4 FADS1-207ENST00000466716 640 ntTSL 523.53■■□□□ 1.366e-8■■■■■ 46.7
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