Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLCO1B3Q9NPD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO1B3Q9NPD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO1B3Q9NPD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO1B3Q9NPD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms