Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMBIM4Q9HC24 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMBIM4Q9HC24 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMBIM4Q9HC24 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMBIM4Q9HC24 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMBIM4Q9HC24 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMBIM4Q9HC24 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMBIM4Q9HC24 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMBIM4Q9HC24 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMBIM4Q9HC24 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMBIM4Q9HC24 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms