Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC114Q96M63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC114Q96M63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC114Q96M63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC114Q96M63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC114Q96M63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC114Q96M63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC114Q96M63 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms