Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC114Q96M63 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC114Q96M63 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC114Q96M63 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC114Q96M63 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CCDC114Q96M63 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC114Q96M63 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC114Q96M63 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC114Q96M63 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC114Q96M63 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC114Q96M63 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC114Q96M63 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC114Q96M63 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC114Q96M63 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC114Q96M63 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC114Q96M63 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC114Q96M63 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC114Q96M63 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC114Q96M63 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC114Q96M63 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC114Q96M63 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC114Q96M63 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC114Q96M63 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC114Q96M63 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC114Q96M63 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC114Q96M63 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC114Q96M63 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC114Q96M63 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC114Q96M63 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC114Q96M63 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC114Q96M63 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC114Q96M63 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC114Q96M63 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC114Q96M63 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC114Q96M63 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC114Q96M63 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC114Q96M63 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC114Q96M63 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC114Q96M63 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC114Q96M63 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC114Q96M63 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC114Q96M63 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC114Q96M63 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC114Q96M63 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC114Q96M63 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC114Q96M63 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC114Q96M63 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC114Q96M63 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC114Q96M63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC114Q96M63 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC114Q96M63 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC114Q96M63 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC114Q96M63 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC114Q96M63 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC114Q96M63 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC114Q96M63 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC114Q96M63 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC114Q96M63 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC114Q96M63 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC114Q96M63 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC114Q96M63 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC114Q96M63 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC114Q96M63 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC114Q96M63 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC114Q96M63 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC114Q96M63 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC114Q96M63 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC114Q96M63 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC114Q96M63 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC114Q96M63 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC114Q96M63 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC114Q96M63 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC114Q96M63 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC114Q96M63 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC114Q96M63 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC114Q96M63 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC114Q96M63 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC114Q96M63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC114Q96M63 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC114Q96M63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC114Q96M63 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC114Q96M63 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC114Q96M63 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC114Q96M63 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC114Q96M63 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC114Q96M63 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC114Q96M63 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC114Q96M63 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC114Q96M63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC114Q96M63 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC114Q96M63 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC114Q96M63 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC114Q96M63 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC114Q96M63 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC114Q96M63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC114Q96M63 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC114Q96M63 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC114Q96M63 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC114Q96M63 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC114Q96M63 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms