Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYP26C1Q6V0L0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYP26C1Q6V0L0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP26C1Q6V0L0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms