Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP221Q4G0U5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP221Q4G0U5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP221Q4G0U5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP221Q4G0U5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP221Q4G0U5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms