Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX1Q16384 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX1Q16384 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX1Q16384 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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