Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELQ04864 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELQ04864 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELQ04864 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELQ04864 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELQ04864 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELQ04864 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELQ04864 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RELQ04864 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RELQ04864 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RELQ04864 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RELQ04864 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RELQ04864 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RELQ04864 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RELQ04864 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RELQ04864 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RELQ04864 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RELQ04864 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RELQ04864 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RELQ04864 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RELQ04864 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RELQ04864 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RELQ04864 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RELQ04864 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RELQ04864 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RELQ04864 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RELQ04864 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RELQ04864 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RELQ04864 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RELQ04864 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RELQ04864 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RELQ04864 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RELQ04864 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RELQ04864 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RELQ04864 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RELQ04864 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RELQ04864 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RELQ04864 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RELQ04864 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RELQ04864 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RELQ04864 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RELQ04864 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RELQ04864 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RELQ04864 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RELQ04864 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RELQ04864 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RELQ04864 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RELQ04864 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RELQ04864 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RELQ04864 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RELQ04864 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RELQ04864 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RELQ04864 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RELQ04864 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RELQ04864 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RELQ04864 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RELQ04864 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RELQ04864 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RELQ04864 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RELQ04864 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RELQ04864 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RELQ04864 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RELQ04864 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RELQ04864 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RELQ04864 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RELQ04864 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RELQ04864 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RELQ04864 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RELQ04864 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RELQ04864 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RELQ04864 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELQ04864 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELQ04864 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELQ04864 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELQ04864 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RELQ04864 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms