Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RELQ04864 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RELQ04864 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RELQ04864 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RELQ04864 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RELQ04864 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RELQ04864 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RELQ04864 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RELQ04864 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RELQ04864 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RELQ04864 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RELQ04864 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RELQ04864 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RELQ04864 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RELQ04864 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RELQ04864 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RELQ04864 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RELQ04864 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RELQ04864 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RELQ04864 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RELQ04864 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RELQ04864 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RELQ04864 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RELQ04864 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELQ04864 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELQ04864 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RELQ04864 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RELQ04864 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELQ04864 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELQ04864 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELQ04864 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RELQ04864 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELQ04864 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELQ04864 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELQ04864 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELQ04864 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELQ04864 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELQ04864 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELQ04864 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RELQ04864 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELQ04864 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RELQ04864 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RELQ04864 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RELQ04864 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELQ04864 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELQ04864 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELQ04864 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELQ04864 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELQ04864 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELQ04864 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELQ04864 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELQ04864 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RELQ04864 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RELQ04864 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RELQ04864 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELQ04864 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELQ04864 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELQ04864 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RELQ04864 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELQ04864 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELQ04864 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RELQ04864 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RELQ04864 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RELQ04864 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RELQ04864 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RELQ04864 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RELQ04864 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RELQ04864 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RELQ04864 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELQ04864 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELQ04864 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELQ04864 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RELQ04864 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RELQ04864 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RELQ04864 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELQ04864 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RELQ04864 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RELQ04864 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RELQ04864 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RELQ04864 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RELQ04864 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RELQ04864 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RELQ04864 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RELQ04864 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RELQ04864 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELQ04864 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RELQ04864 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RELQ04864 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RELQ04864 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELQ04864 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RELQ04864 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELQ04864 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RELQ04864 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELQ04864 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RELQ04864 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELQ04864 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELQ04864 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELQ04864 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELQ04864 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELQ04864 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms