Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP27A1Q02318 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP27A1Q02318 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms