Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CYP27A1Q02318 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CYP27A1Q02318 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CYP27A1Q02318 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CYP27A1Q02318 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CYP27A1Q02318 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CYP27A1Q02318 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CYP27A1Q02318 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CYP27A1Q02318 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CYP27A1Q02318 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CYP27A1Q02318 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CYP27A1Q02318 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CYP27A1Q02318 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CYP27A1Q02318 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CYP27A1Q02318 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CYP27A1Q02318 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CYP27A1Q02318 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CYP27A1Q02318 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CYP27A1Q02318 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CYP27A1Q02318 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CYP27A1Q02318 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CYP27A1Q02318 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CYP27A1Q02318 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CYP27A1Q02318 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CYP27A1Q02318 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CYP27A1Q02318 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYP27A1Q02318 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CYP27A1Q02318 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP27A1Q02318 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CYP27A1Q02318 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CYP27A1Q02318 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CYP27A1Q02318 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CYP27A1Q02318 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CYP27A1Q02318 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYP27A1Q02318 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CYP27A1Q02318 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CYP27A1Q02318 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CYP27A1Q02318 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CYP27A1Q02318 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CYP27A1Q02318 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CYP27A1Q02318 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CYP27A1Q02318 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CYP27A1Q02318 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CYP27A1Q02318 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CYP27A1Q02318 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CYP27A1Q02318 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CYP27A1Q02318 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CYP27A1Q02318 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CYP27A1Q02318 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CYP27A1Q02318 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CYP27A1Q02318 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CYP27A1Q02318 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CYP27A1Q02318 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CYP27A1Q02318 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CYP27A1Q02318 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CYP27A1Q02318 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CYP27A1Q02318 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CYP27A1Q02318 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CYP27A1Q02318 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CYP27A1Q02318 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CYP27A1Q02318 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CYP27A1Q02318 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CYP27A1Q02318 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CYP27A1Q02318 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CYP27A1Q02318 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CYP27A1Q02318 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CYP27A1Q02318 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CYP27A1Q02318 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CYP27A1Q02318 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CYP27A1Q02318 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CYP27A1Q02318 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CYP27A1Q02318 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CYP27A1Q02318 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CYP27A1Q02318 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CYP27A1Q02318 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CYP27A1Q02318 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CYP27A1Q02318 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CYP27A1Q02318 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CYP27A1Q02318 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CYP27A1Q02318 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CYP27A1Q02318 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CYP27A1Q02318 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CYP27A1Q02318 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CYP27A1Q02318 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CYP27A1Q02318 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CYP27A1Q02318 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CYP27A1Q02318 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CYP27A1Q02318 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CYP27A1Q02318 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CYP27A1Q02318 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CYP27A1Q02318 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CYP27A1Q02318 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CYP27A1Q02318 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CYP27A1Q02318 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CYP27A1Q02318 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CYP27A1Q02318 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CYP27A1Q02318 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CYP27A1Q02318 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CYP27A1Q02318 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CYP27A1Q02318 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms