Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A2Q01362 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A2Q01362 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms