Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TERF1P54274 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TERF1P54274 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TERF1P54274 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TERF1P54274 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TERF1P54274 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TERF1P54274 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TERF1P54274 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TERF1P54274 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TERF1P54274 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TERF1P54274 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TERF1P54274 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TERF1P54274 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TERF1P54274 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TERF1P54274 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TERF1P54274 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TERF1P54274 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TERF1P54274 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TERF1P54274 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TERF1P54274 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TERF1P54274 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TERF1P54274 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TERF1P54274 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TERF1P54274 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TERF1P54274 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TERF1P54274 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TERF1P54274 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TERF1P54274 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TERF1P54274 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TERF1P54274 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TERF1P54274 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TERF1P54274 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TERF1P54274 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TERF1P54274 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TERF1P54274 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TERF1P54274 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TERF1P54274 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TERF1P54274 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TERF1P54274 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TERF1P54274 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TERF1P54274 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TERF1P54274 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TERF1P54274 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TERF1P54274 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TERF1P54274 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TERF1P54274 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TERF1P54274 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TERF1P54274 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TERF1P54274 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TERF1P54274 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TERF1P54274 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TERF1P54274 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TERF1P54274 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TERF1P54274 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TERF1P54274 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TERF1P54274 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TERF1P54274 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TERF1P54274 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TERF1P54274 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TERF1P54274 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TERF1P54274 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TERF1P54274 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TERF1P54274 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TERF1P54274 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TERF1P54274 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TERF1P54274 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TERF1P54274 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TERF1P54274 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TERF1P54274 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TERF1P54274 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TERF1P54274 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TERF1P54274 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TERF1P54274 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TERF1P54274 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TERF1P54274 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TERF1P54274 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TERF1P54274 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms