Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ZEB1P37275 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ZEB1P37275 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ZEB1P37275 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ZEB1P37275 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ZEB1P37275 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ZEB1P37275 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms