Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11AO75192 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11AO75192 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11AO75192 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PEX11AO75192 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368.2 ms