Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RIPK2O43353 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIPK2O43353 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIPK2O43353 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIPK2O43353 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms