Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIPK2O43353 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RIPK2O43353 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIPK2O43353 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIPK2O43353 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RIPK2O43353 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RIPK2O43353 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RIPK2O43353 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RIPK2O43353 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RIPK2O43353 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RIPK2O43353 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RIPK2O43353 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RIPK2O43353 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RIPK2O43353 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RIPK2O43353 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RIPK2O43353 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RIPK2O43353 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RIPK2O43353 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RIPK2O43353 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RIPK2O43353 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RIPK2O43353 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RIPK2O43353 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RIPK2O43353 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RIPK2O43353 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RIPK2O43353 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RIPK2O43353 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RIPK2O43353 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RIPK2O43353 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RIPK2O43353 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RIPK2O43353 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RIPK2O43353 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RIPK2O43353 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RIPK2O43353 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RIPK2O43353 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RIPK2O43353 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RIPK2O43353 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RIPK2O43353 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RIPK2O43353 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RIPK2O43353 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RIPK2O43353 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RIPK2O43353 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RIPK2O43353 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RIPK2O43353 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RIPK2O43353 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RIPK2O43353 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RIPK2O43353 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RIPK2O43353 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RIPK2O43353 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RIPK2O43353 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RIPK2O43353 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RIPK2O43353 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RIPK2O43353 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RIPK2O43353 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RIPK2O43353 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RIPK2O43353 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RIPK2O43353 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RIPK2O43353 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RIPK2O43353 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RIPK2O43353 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIPK2O43353 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIPK2O43353 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RIPK2O43353 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RIPK2O43353 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RIPK2O43353 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RIPK2O43353 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIPK2O43353 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RIPK2O43353 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RIPK2O43353 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RIPK2O43353 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RIPK2O43353 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RIPK2O43353 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RIPK2O43353 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RIPK2O43353 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RIPK2O43353 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RIPK2O43353 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RIPK2O43353 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RIPK2O43353 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RIPK2O43353 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RIPK2O43353 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RIPK2O43353 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RIPK2O43353 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RIPK2O43353 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK2O43353 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RIPK2O43353 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIPK2O43353 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK2O43353 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RIPK2O43353 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIPK2O43353 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK2O43353 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIPK2O43353 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIPK2O43353 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIPK2O43353 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RIPK2O43353 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms