Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A7O00341 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A7O00341 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A7O00341 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A7O00341 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms