Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF103O00237 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF103O00237 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF103O00237 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF103O00237 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF103O00237 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF103O00237 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF103O00237 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF103O00237 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF103O00237 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF103O00237 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF103O00237 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF103O00237 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF103O00237 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF103O00237 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF103O00237 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF103O00237 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF103O00237 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF103O00237 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF103O00237 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF103O00237 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF103O00237 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF103O00237 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF103O00237 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF103O00237 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF103O00237 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF103O00237 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF103O00237 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF103O00237 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF103O00237 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF103O00237 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF103O00237 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF103O00237 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF103O00237 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF103O00237 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF103O00237 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF103O00237 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF103O00237 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF103O00237 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF103O00237 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF103O00237 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF103O00237 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF103O00237 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF103O00237 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF103O00237 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF103O00237 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF103O00237 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF103O00237 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF103O00237 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF103O00237 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF103O00237 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF103O00237 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF103O00237 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF103O00237 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF103O00237 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF103O00237 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF103O00237 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF103O00237 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF103O00237 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF103O00237 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF103O00237 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF103O00237 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF103O00237 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF103O00237 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF103O00237 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF103O00237 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF103O00237 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF103O00237 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF103O00237 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF103O00237 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF103O00237 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF103O00237 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF103O00237 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF103O00237 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF103O00237 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF103O00237 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF103O00237 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF103O00237 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF103O00237 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF103O00237 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms