Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GABARAPH6UMI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPH6UMI1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPH6UMI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPH6UMI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms