Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GABARAPH6UMI1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABARAPH6UMI1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABARAPH6UMI1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABARAPH6UMI1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GABARAPH6UMI1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GABARAPH6UMI1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GABARAPH6UMI1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GABARAPH6UMI1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABARAPH6UMI1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABARAPH6UMI1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GABARAPH6UMI1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABARAPH6UMI1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GABARAPH6UMI1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABARAPH6UMI1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABARAPH6UMI1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GABARAPH6UMI1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABARAPH6UMI1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABARAPH6UMI1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABARAPH6UMI1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABARAPH6UMI1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABARAPH6UMI1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABARAPH6UMI1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABARAPH6UMI1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABARAPH6UMI1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GABARAPH6UMI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GABARAPH6UMI1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GABARAPH6UMI1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABARAPH6UMI1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GABARAPH6UMI1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABARAPH6UMI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABARAPH6UMI1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABARAPH6UMI1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABARAPH6UMI1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABARAPH6UMI1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABARAPH6UMI1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABARAPH6UMI1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABARAPH6UMI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABARAPH6UMI1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABARAPH6UMI1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABARAPH6UMI1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABARAPH6UMI1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABARAPH6UMI1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABARAPH6UMI1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABARAPH6UMI1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABARAPH6UMI1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABARAPH6UMI1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABARAPH6UMI1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABARAPH6UMI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABARAPH6UMI1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABARAPH6UMI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABARAPH6UMI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABARAPH6UMI1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABARAPH6UMI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABARAPH6UMI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABARAPH6UMI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABARAPH6UMI1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABARAPH6UMI1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABARAPH6UMI1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABARAPH6UMI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABARAPH6UMI1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABARAPH6UMI1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABARAPH6UMI1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABARAPH6UMI1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABARAPH6UMI1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GABARAPH6UMI1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABARAPH6UMI1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABARAPH6UMI1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABARAPH6UMI1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABARAPH6UMI1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABARAPH6UMI1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABARAPH6UMI1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABARAPH6UMI1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABARAPH6UMI1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABARAPH6UMI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABARAPH6UMI1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABARAPH6UMI1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABARAPH6UMI1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABARAPH6UMI1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABARAPH6UMI1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms